[seminar] Sanjin Marion, doktorski seminar sutra (srijeda) u 10h

[Nenad Pavin]

SANJIN MARION će sutra održati znanstveni kolokvij (doktorski seminar) iz Biofizike. Sanjin radi doktorat iz fizike u grupi Antonia Šibera. 

Naslov: Sažimanje nukleinskih kiselina: fizikalni mehanizmi i biološka relevantnost

Pakiranje nukleinskih kiselina u ograničene prostore (kao u prirodi) je primjer zanimljivog problema sažimanja jako nabijenog dugačkog polimera u prostor koji je potencijalno već ispunjen gusto pakiranim česticama (npr. proteinima). Virusi posjeduju veliku količinu genetskog materijala koji je zapisan pomoću nukleinskih kiselina spakiranih u malenom prostoru, što rezultira velikom gustoćom pakiranja. Interakcije koje proizlaze iz takvog pakiranja povezane su s prostornom ograničenošću što rezultira kompleksnijim faznim dijagramom od onog kod makroskopskog materijala. U ovom radu bavimo se problemom pakiranja DNK u ograničene prostore u kontekstu fizikalne virologije. Proučava se pakiranje za faze čiste DNK u slabom i jakom prostornom ograničenju u kontekstu ejekcije genetskog materijala iz bakteriofaga u bakterije. Pokazuje se za uspješnu ejekciju iz bakteriofaga nije nužno korištenje staničnih motora. Također, proučava se struktura mješavina DNK i vezujućih proteina putem molekularne dinamike. Model upućuje na biološke prednosti prisustva kondenzacijskih proteina te nedostatak očekivanog uređenja unutar viralnih kapsida u skladu s eksperimentalnim opažanjima u adenovirusima.

Seminar će se održati u utorak, 25. listopada 2016. godine, u 10:00  sati, u predavaoni  F-201 (seminar) Fizičkog odsjeka PMF-a, Bijenička 32, Zagreb.


-- 
Nenad Pavin PhD.
Associate Professor
Department of Physics, Faculty of Science
University of Zagreb
Zagreb 10002, Croatia
Phone:	+385 (1) 460 5663;  +385 (95) 811 6757
Email:	npavin at phy.hr
http://www.phy.pmf.unizg.hr/~npavin

-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://www.phy.pmf.unizg.hr/pipermail/seminar/attachments/20161122/6bce1525/attachment.html>