<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=utf-8"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">SANJIN MARION će sutra održati znanstveni kolokvij (doktorski seminar) iz Biofizike. Sanjin radi doktorat iz fizike u grupi Antonia Šibera. <br class=""><br class="">Naslov: Sažimanje nukleinskih kiselina: fizikalni mehanizmi i biološka relevantnost<div class=""><br class="">Pakiranje nukleinskih kiselina u ograničene prostore (kao u prirodi) je primjer zanimljivog problema sažimanja jako nabijenog dugačkog polimera u prostor koji je potencijalno već ispunjen gusto pakiranim česticama (npr. proteinima). Virusi posjeduju veliku količinu genetskog materijala koji je zapisan pomoću nukleinskih kiselina spakiranih u malenom prostoru, što rezultira velikom gustoćom pakiranja. Interakcije koje proizlaze iz takvog pakiranja povezane su s prostornom ograničenošću što rezultira kompleksnijim faznim dijagramom od onog kod makroskopskog materijala. U ovom radu bavimo se problemom pakiranja DNK u ograničene prostore u kontekstu fizikalne virologije. Proučava se pakiranje za faze čiste DNK u slabom i jakom prostornom ograničenju u kontekstu ejekcije genetskog materijala iz bakteriofaga u bakterije. Pokazuje se za uspješnu ejekciju iz bakteriofaga nije nužno korištenje staničnih motora. Također, proučava se struktura mješavina DNK i vezujućih proteina putem molekularne dinamike. Model upućuje na biološke prednosti prisustva kondenzacijskih proteina te nedostatak očekivanog uređenja unutar viralnih kapsida u skladu s eksperimentalnim opažanjima u adenovirusima.</div><div class=""><br class="">Seminar će se održati u utorak, 25. listopada 2016. godine, u 10:00 sati, u predavaoni F-201 (seminar) Fizičkog odsjeka PMF-a, Bijenička 32, Zagreb.<br class=""><br class=""><br class=""><div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">-- <br class="">Nenad Pavin PhD.<br class="">Associate Professor<br class="">Department of Physics, Faculty of Science<br class="">University of Zagreb<br class="">Zagreb 10002, Croatia<br class="">Phone:<span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;"> </span>+385 (1) 460 5663; +385 (95) 811 6757<br class="">Email:<span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;"> </span><a href="mailto:npavin@phy.hr" class="">npavin@phy.hr</a><br class="">http://www.phy.pmf.unizg.hr/~npavin</div>
</div>
<br class=""></div></body></html>