[seminar] Kolokvij FO , Tomić

[hbuljan at phy.hr]

Poštovani kolege,

   idući utorak s početkom u 14.15 sati predavanje naslovljeno
"Struktura i dinamika vodenih otopina Na-DNA" održati će nam
Dr. Silvia Tomić s Instituta za fiziku. Predavanje će se održati
u predavaonici F08.
   Sažetak predavanja nalazi se u nastavku poruke.

Srdačan pozdrav,
Hrvoje Buljan

----------------------------------------------------
KOLOKVIJ FIZIČKOG ODSJEKA
-----------------------------------------------------------

Vrijeme:   utorak, 10. 03. 2009., 14:15 sati (točno)
Mjesto:     Fizički odsjek, Bijenička c. 32, predavaonica F08

   Struktura i dinamika vodenih otopina Na-DNA

              Dr. Silvia Tomić
           Institut za fiziku, Zagreb
                 (stomic at ifs.hr)

Istraživana su strukturna svojstva vodenih otopina Na-DNA u ovisnosti DNA
koncentracije, koncentracije dodane soli i dužine DNA lanaca [1,2,3].
Tehnikom dielektrične spektroskopije su detektirana dva relaksacijska moda
u frekventnom podrucju izmedju 100 Hz i 100 MHz koja se mogu pridjeliti
difuznom kretanju intrinsičnih DNA protuiona. Usporedbom karakterističnih
prostornih skala iz eksperimenta s fundamentalnim prostornim skalama koje
predviđa standardna teorija [4] utvrdjeno je da niskofrekventni mod
opisuje strukturna svojstva pojedinog DNA lanca, dok visokofrekventni mod
karakterizira strukturna svojstva DNA otopine kao cjeline koja se sastoji
od mnoštva DNA lanaca. Eksperimentalni rezultati su također jasno ukazali
na međusobne uloge instrinsičnih DNA protuiona i iona dodane soli u
zasjenjenju sto je posebno važno za rješavanje kontroverznog problema DNA
konformacije u cistim vodenim otopinama. Konačno, rezultati dielektricne
spektroskopije su otkrili da dvostruka uzvojnica kratkih DNA segmenata
pokazuje iznenadjujuce visoku fleksibilnost koja je u suprotnosti s
predviđanjima standardne teorije [3]. Ti rezultati mogu se razumjeti kao
posljedica dinamički formiranih denaturacijskih mjehurića odnosno disanjem
parova baza i u skladu su s rezultatima dobivenim tehnikama FRET
(fluorescence resonance energy transfer) i SAXS (small angle X-ray
scattering) [5]. Na kraju, otvorena će pitanja biti prodiskutirana i
mogući smjerovi budućih istraživanja biti će naznačeni.


1. S.Tomić, T.Vuletić, S.Dolanski-Babić, S.Krca, D.Ivanković, L.Griparić
and R.Podgornik, Phys. Rev. Lett. 97, 098303 (2006).
2. S.Tomić, S.Dolanski-Babić, T.Vuletić, S.Krca, D.Ivankovic, L.Griparić
and R.Podgornik, Phys. Rev. E 75, 021905 (2007).
3. S.Tomić, S.Dolanski-Babić, T.Ivek, T. Vuletić, S. Krca, F.Livolant and
R. Podgornik, Europhys. Letters 81, 68003 (2008).
4. A.V.Dobrynin and M.Rubinstein, Prog. Polym. Sci. 30, 1049 (2005).
5. C.Yuan, H.Chen, X.W.Lou, and L.A.Archer, Phys. Rev. Lett. 100, 018102
(2008).

	                Voditelj seminara FO
		       Hrvoje Buljan, hbuljan at phy.hr
-----------------------------------------------------------