[seminar] 02. 03. 2022. Maja Novak: Strateško odlučivanje kod stanične kemotaksije i veza sa samoorganizacijom

[Sanjin Benić]

Drage kolegice i kolege,
Drago mi je da mogu najaviti sljedeci Seminar Fizičkog odsjeka:

Dear colleagues,
I would like to invite you to the following Seminar of the Department of
Physics:

srijeda/Wednesday 02.03.2022. u 14 h (c.t.)

Strateško odlučivanje kod stanične kemotaksije i veza sa samoorganizacijom

Maja Novak

Fizički odsjek, Prirodoslovno-Matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu

Bitno svojstvo bioloških sustava je obrada informacija o okolišu, kao i
skup strategija po kojima se  sustav ponaša ovisno o tim informacijama.
Kako bi stanice pronašle hranu, izbjegle toksine i pronašle druge
stanice,  one procjenjuju koncentraciju određenih molekula u okolini, te
korištenjem te informacije prilagođavaju svoje kretanje. Ovo svojstvo je
poznato kao kemotaksija. Da bismo proučavali staničnu kemotaksiju
razvili smo model temeljen na Bayesovom algoritmu za procjenu
koncentracije molekula i odabiru optimalne strategije za pronalazak
globalnog maksimuma te koncentracije. Model uzima u obzir šum koji je
prisutan pri vezivanju molekula na receptore stanice tijekom
kemotaksije, što smanjuje pouzdanost procjene koncentracije molekula kao
i njezinog gradijenta. Iz modela dobivamo da se pouzdanost procjene
gradijenta koncentracije povećava uzastopnim korištenjem Bayesovog
algoritma. Proučavanjem gornje granice pouzdanosti procjene odredili smo
efikasnost Bayesovog algoritma. Pokazali smo da stanice efikasno
pronalaze maksimum koncentracije ako odaberu smjer kretanja koji
maksimizira predviđenu informaciju o položaju tog maksimuma, dobivenu na
temelju povijesti zauzeća receptora na stanici. Osim kemotaksije,
također proučavamo samoorganizaciju koja je odgovorna za formiranje i
ispravno funkcioniranje diobenog vretena. U budućnosti planiramo
povezati gore spomenute principe informiranog odlučivanja i
samoorganizacije u biološkim sustavima, kako bismo opisali složenije
fenomene poput životnog ciklusa stanice.


Cjeloviti oglas je u prilogu./Formatted announcement is attached.

Lijep pozdrav / Best regards
Sanjin Benic i Damjan Pelc
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://www.phy.pmf.unizg.hr/pipermail/seminar/attachments/20220221/2dafb993/attachment-0001.htm>
-------------- next part --------------
A non-text attachment was scrubbed...
Name: sfo3.pdf
Type: application/pdf
Size: 31552 bytes
Desc: not available
URL: <http://www.phy.pmf.unizg.hr/pipermail/seminar/attachments/20220221/2dafb993/attachment-0001.pdf>