[seminar] Seminar na IF-u 13. studenoga 2014. (četvrtak) u 15:00 sati - Danijel Grgičin: Novi pristup izučavanju denaturacije DNK

[Osor Barisic]

ZAJEDNIČKI SEMINAR 

Hrvatskog biofizičkog društva i Instituta za fiziku 

13. studenoga 2014. (četvrtak) u 15:00 sati 

Institut za fiziku, Bijenička cesta 46, predavaonica u III krilu 




Danijel Grgičin Institut za fiziku, Zagreb 




Novi pristup izučavanju denaturacije DNK 




U deoksiribonukleinskoj kiselini (DNK) živih organizama genetska informacija je pohranjena u konformaciji dvostruke uzvojnice (ds). Međutim, prepisivanje genetske informacije u svrhu izrade proteina ili u svrhu kopiranja genetske informacije se odvija na konformaciji jednostruke uzvojnice (ss). Efekt slaganja baza (eng. base stacking) i vodikove veze čuvaju DNK u ds konformaciji, dok repulzija fosfatnih grupa destabilizira DNK. Kada potonje prevlada DNK se denaturira u ss konformaciju. Od 1970.-tih se denaturacija DNA rutinski prati UV apsorbancijom. Ovdje izvještavamo o našem pristupu koji kombinacijom dielektrične spektroskopije i konduktometrije omogućava određivanje međusobne udaljenosti DNK lanaca, tj. de Gennesovu korelacijsku duljinu kao i broj protuiona kondenziranih na DNK. Udaljenost lanaca govori o njihovoj koncentraciji te može ukazivati na denaturaciju a važnost određivanja broja kondenziranih protuiona je u činjenici da oni neutraliziraju fosfatne grupe, tj. poznavanjem njihova udjela se može odrediti sila koja djeluje na fosfatne grupe i uzrokuje denaturaciju. 



* * * 



D. Grgičin, zn. novak na Institutu na fiziku od 2010, predstavlja svoj rad u području fizike polielektrolita: 

D. Grgičin (T. Vuletić, S. Tomić) et al. 

Phys. Rev. E 88, 052703 (2013) - Effect of magnesium ions on dielectric relaxation in semidilute DNA aqueous solutions 

Phys. Rev. E 83, 041803 (2011) - Manning free counterions fraction for a rod-like polyion – short DNA fragments in very low salt 

Phys. Rev. E 82, 011922 (2010) - Structure and dynamics of hyaluronic acid semidilute solutions: a dielectric spectroscopy study 

D. Grgičin je nedavno održao i predavanja na konferenciji From Solid State to BioPhysics , 7-14.06. 2014, Cavtat, i na školi 12 th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics , 27.9.-6.10. 2014, Primošten. 




Voditelji seminara IF-a: Nikša Krstulović i Osor Barišić 
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://www.phy.pmf.unizg.hr/pipermail/seminar/attachments/20141110/def21aa8/attachment-0001.html>
-------------- next part --------------
A non-text attachment was scrubbed...
Name: image003.jpg
Type: image/jpeg
Size: 93084 bytes
Desc: not available
URL: <http://www.phy.pmf.unizg.hr/pipermail/seminar/attachments/20141110/def21aa8/attachment-0001.jpg>
-------------- next part --------------
A non-text attachment was scrubbed...
Name: image001.png
Type: image/png
Size: 20913 bytes
Desc: not available
URL: <http://www.phy.pmf.unizg.hr/pipermail/seminar/attachments/20141110/def21aa8/attachment-0001.png>