[seminar] Seminar FO , Glunčić

[hbuljan at phy.hr]

Poštovani kolege,

Podsjećam na današnje predavanje.

Srdačan pozdrav
Hrvoje Buljan

-------------------------------------------
SEMINAR FIZIČKOG ODSJEKA
-------------------------------------------

Vrijeme:   utorak, 15. 2. 2011., 14:15 sati (točno)
Mjesto:     Fizički odsjek, Bijenička c. 32, predavaonica F102

Novi algoritam Global Repeat Map (GRM) za direktno preslikavanje
 DNK simboličke sekvence u frekvencijsko područje i primjena na
             genome čovjeka i čimpanze

               Matko Glunčić
               Fizički odsjek,
  Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Prikaz osnova GRM algoritma stvorenog u Zagrebu kao kompjuterske metode
koja direktno preslikava DNK sekvencu u frekvencijsku domenu i daje
globalnu repeticijsku mapu sa svim signifikantnim repeticijskim
jedinicama, odgovarajuće konsenzusne sekvence i divergencije među
repeticijskim kopijama. Kompletan račun tandemskih struktura i repeticija
višeg reda (HOR) za kromozome 1 i Y u genomima čovjeka i čimpanze i
njihova usporedba. Otkriće novih signifikantnih divergencija između
čovjeka i čimpanze. Otkriće novih repeticija višeg reda kao signature
značajnih i do sada nepoznatih evolucijskih razlika između čovjeka i
čimpanze, kao na primjer NBPF (Neuroblastoma BreakPoint Family) gene HOR u
ljudskom kromozomu 1.

Rezultati objavljeni u dvije nove publikacije:

V. Paar, M. Glunčić, I.Basar, M. Rosandić, P. Paar, M. Cvitković (2010)
Large Tandem, Higher Order Repeats and Regularly Dispersed Repeat Units
Contribute Substantially to Divergence Between Human and Chimpanzee Y
Chromosomes. J Mol Evol  72:34-55 doi: 10.1007/s00239-010-9401-8

V. Paar, M. Glunčić, M. Rosandić, I.Basar, I. Vlahović (2011) Intra-Gene
Higher Order Repeats in Neuroblastoma BreakPoint Family (NBPF) Genes
Distinguish Humans from Chimpanzees. Mol Biol Evol doi:
10.1093/molbev/msr009.

			Voditelj seminara FO
			Hrvoje Buljan, hbuljan at phy.hr
------------------------------------------